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形态/ DNA条形码

形态和DNA条形码项目,使使用相同的序列数据的唯一性。因此,推论可以通过acerca两个目标收集和序列的系统发育分析进行。

形态

为褐藻的分类是非常没有解决,有太多的问候形态事件进行研究。了解褐藻的进化史将帮助我们更好地分类藻类,藻类理解之间,从单细胞到多细胞的转变,流动制度对发展的影响海洋盆地的运动。在形态事件的研究需要多于一个经常基因区域,能够进行推理关于物种的事件。

DNA条形码

DNA条形码已在红色,绿色和一些褐藻研究成功应用。 DNA条形码是短基因区域也就是说,十一测序,给出了明确的物种的身份。有了选择,以确定身份的分子种类INSTEAD形态变异避免了由于与表型可塑性率高的误认问题。 DNA条形码是有效的依据关于700对和聚焦在一个或部分基因区域。

Brian analyzes a gel.赤子爱胜梓

海带森林是在世界各地的温带潮线下社区非常生产力的生态系统。研究表明,过去的水流深,浅潮下带区域之间的动水压力的差异可能藻类形态的形状。 赤子爱胜梓 是海带物种随着浅的一例潮下种群潮下和邻近岛卡塔利娜,加利福尼亚州,每个与不同的形态深区域。是否形态分化由遗传或表型可塑性引起仍不清楚差异。 ESTA研究的目的是确定这些是否仍然适应于两种不同的环境或充分多元化具有被认为是两个不同的物种一个物种种群。从所有的样品采集的样本来自两个潮下这些人群和提取DNA。基于在从整个基因组DNA提取的多糖含量的差异;变化这两个群体之间是很明显的。 2个基因区域,核酮(扩增和测序)的5“LSU [Z片段]和线粒体(COX 5月1”末端者。对于LSUŽ片段系统发育分析和 COX 5月1日“ 基因区域表现为遗传变异的显著量。都显示有希望成为DNA条形码/标记在浅或深的个体人群区分。进一步测序和两个群体都基因区域的系统发育分析将随着令人振奋的结果按照执行。

DNA条形码在 马尾

马尾 是产生的最重要和最广泛的生态褐藻之一。无论是一般属大型形成上层浮床或矗立于热带亚热带海岸海洋盆地到世界各地。然而,仍有许多有待发现关于ITS系统发育和进化的历史,但进展是由无法识别100%准确的物种阻碍。与识别的问题是由于表型可塑性和亲缘种的高利率,以及缺乏对加勒比研究 马尾 种。这是巴拿马的沿海地区,其中多样性的估计均高有许多潜在的未被发现的品种更是如此。一个DNA条形码的发展 马尾 将解决问题基于系统发育分析的形态和供应数据的传统标识。 ESTA项目的目标是三个基因区域条形编码工具比较,并利用这些数据作出贡献的决议 马尾的发展史。来自加勒比海和太平洋二十一个样本区周围获得了巴拿马。是使用改进的CTAB方法以及使用GenomiPhi全基因组扩增的DNA的方法来存档提取的样品。分别选择几个基因区,扩增(例如LSU, RBC升和其-2)中并测序。都是21个样品成功地提取和全基因组扩增的产品存档以备将来使用进行。主比对单基因区被建造用于使用新的和GenBank数据的属。系统发育分析产生的最大似然树的自举表明,LSU不片段Z有足够的变化,以用作条形码。未来的方向对于这项研究将集中在配对LSU LSU Z,使用另一种基因片段或其他地区。 

ascoseira

ascoseria 是的藻类是特有的南极恶劣条件下的唯一物种。顺序ascosierales,像其他褐藻订单,拥有一支悬而未决分类。 ascoseira杆菌 之间的不同的形态展品区和安静,湍流制度。在长度是否菌柄差异是由于可塑性的或自适应的进化变化是不明的。从三个独立的区域标本收集,总基因组DNA提取和ITS-2区域的扩增和 RBCL的开展。被比对的序列,并进行了系统发育分析。没有足够的变化是在基因区域发现,以确定是否物种的两个群体之间出现了。未来的研究将专注于其他基因区的若干以及radtag分析。